More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1024 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  100 
 
 
213 aa  440  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  42.05 
 
 
214 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  41.75 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  38.58 
 
 
204 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  40.1 
 
 
204 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  39.49 
 
 
211 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  37.88 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  33.17 
 
 
205 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  34.67 
 
 
205 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  34.46 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  31.98 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  34.46 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  31.82 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  33.9 
 
 
205 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  33.99 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  32.38 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  34.64 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  36.59 
 
 
213 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  34.01 
 
 
200 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  36.02 
 
 
209 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.21 
 
 
213 aa  104  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  34.97 
 
 
202 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  32.28 
 
 
202 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  33.51 
 
 
201 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  33.84 
 
 
212 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  32.49 
 
 
200 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  33.33 
 
 
211 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  33.33 
 
 
212 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
208 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  32.84 
 
 
212 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  31.61 
 
 
207 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  31.09 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  32.2 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  32.34 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  31.19 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  32.06 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  32.34 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  31.84 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  29.73 
 
 
200 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  28.86 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  35 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  29.85 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  28.34 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  27.66 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  27.66 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  30.15 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  31.31 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  26.24 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.23 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0935  hypothetical protein  32.07 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0957403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.65 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  25.47 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0870  hypothetical protein  30.05 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.61 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.5 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.77 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  30.2 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.7 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  26.4 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  27.1 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0358  hypothetical protein  29.94 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  27.09 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.83 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.52 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1004  hypothetical protein  31.14 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550693  normal  0.189775 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  26.06 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.78 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  28.43 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1521  hypothetical protein  29.09 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  27.04 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1774  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0210891  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  26.64 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.35 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  26.7 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  37.11 
 
 
395 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  25.12 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  23.47 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2096  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.545065  normal  0.946136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  26.54 
 
 
219 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  24.06 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  24.06 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4764  hypothetical protein  29.52 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  26.44 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.81 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>