More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1165 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  47.51 
 
 
181 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  40.33 
 
 
180 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  40 
 
 
183 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.34 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  38.33 
 
 
170 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  36.46 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.22 
 
 
194 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  36.67 
 
 
194 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.78 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  41.71 
 
 
169 aa  114  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36.78 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.21 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.64 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  37.22 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.26 
 
 
186 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.63 
 
 
176 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.15 
 
 
176 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.9 
 
 
188 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.2 
 
 
179 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.43 
 
 
165 aa  95.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.41 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.81 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.53 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  32.43 
 
 
170 aa  92  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.57 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  35.33 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.39 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  33.54 
 
 
201 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.07 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.53 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  31.38 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.77 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  33.54 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.91 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.94 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  30.43 
 
 
191 aa  84.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  33.54 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  33.54 
 
 
201 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.98 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.73 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.22 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.94 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  34.16 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.76 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.77 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.43 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  31.41 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.06 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.16 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  31.65 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  26.37 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  35.64 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  32.5 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  32.48 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.01 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  30.13 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.73 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.61 
 
 
321 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.06 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  24.88 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.07 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  31.75 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.05 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.1 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  35.07 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  28.8 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  31.94 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.64 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.93 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.73 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.1 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  28.1 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.93 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  32.3 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  28.1 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  31.06 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  32.98 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.53 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  30.13 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  25.79 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  23.94 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.7 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.77 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>