More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0509 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  47.51 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  47.51 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  45.61 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  39.78 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  34.68 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  39.76 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  38.1 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  38.12 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.57 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.26 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  36.46 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  36.69 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  35.47 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  37.35 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.12 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.49 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.92 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.34 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.88 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  36.26 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.43 
 
 		 204 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.35 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.71 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.19 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  33.14 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  31.18 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.28 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  31.41 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  35.84 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.67 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.21 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  34.64 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  29.23 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  33.33 
 
 		 201 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  31.71 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  33.72 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  29.55 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  33.33 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  32.68 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.89 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  24.86 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.28 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  26.9 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.89 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  26.98 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.85 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  32.69 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  31.89 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  32.69 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  31.89 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  32.03 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.44 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.97 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  32.69 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  32.03 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  29.11 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  27.33 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.32 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  32.05 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.1 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.48 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.25 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30.72 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  29.45 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  29.89 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  29.84 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  32.37 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.05 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  26.74 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.49 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.26 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  27.51 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.95 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.18 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  27.11 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.63 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  29.55 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.16 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  25.95 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  29.67 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.43 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.95 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.51 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.43 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.4 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.48 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.72 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.16 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>