More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0218 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  100 
 
 
180 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  42.94 
 
 
186 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.31 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  29.69 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.55 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.28 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.65 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.81 
 
 
170 aa  89  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.71 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.09 
 
 
187 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.13 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.51 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.11 
 
 
174 aa  84.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.02 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.55 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.11 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  36.49 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.92 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.5 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.18 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.47 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  30.34 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.68 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  30.56 
 
 
275 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.95 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.44 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  31.54 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.5 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  31.54 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.16 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  31.58 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.73 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.97 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.2 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.08 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.15 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.95 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.32 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.91 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.3 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.63 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.83 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.56 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.32 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.37 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  27.72 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  27.72 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.79 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  27.72 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.65 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  27.72 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.95 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.89 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.62 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.92 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  29.1 
 
 
274 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  29.12 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.18 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.05 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  27.59 
 
 
225 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.87 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  21.71 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  31.54 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.57 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  29.57 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.94 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  26.79 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.21 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  29.29 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.47 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  29.89 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  26.67 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.8 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.82 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.35 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.81 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.65 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.92 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  32.81 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.85 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.65 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2222  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.81 
 
 
814 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.17 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.53 
 
 
386 aa  62.4  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  26.98 
 
 
275 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  26.56 
 
 
278 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.92 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.33 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  30.2 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.49 
 
 
253 aa  62  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25 
 
 
253 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  24.35 
 
 
274 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.78 
 
 
168 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  27.67 
 
 
241 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  23.53 
 
 
288 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>