More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1641 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  49.27 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  47.45 
 
 		 273 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  47.45 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  37.73 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  40.86 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  40.64 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  40.29 
 
 		 275 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  39.86 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  39.34 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  38.41 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  38.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  41.91 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  37.5 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  32.48 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  32.73 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  34.19 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  36.5 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  32.97 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  31.77 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  35.93 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  35.66 
 
 		 279 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  33.45 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  33.94 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  33.46 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  32.83 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  32.97 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  33.21 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  30.77 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  29.32 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.14 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.14 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.9 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.43 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24.64 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  24.82 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.72 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  29.55 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.6 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.96 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.2 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.38 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.13 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.79 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.77 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.19 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.95 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.32 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.84 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.72 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.12 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  24.44 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.22 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.43 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.81 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.04 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  24.74 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.8 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.41 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.79 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.59 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  30.29 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.42 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.33 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.79 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.16 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.26 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.12 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.32 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.5 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  23.4 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.06 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.26 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.49 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  22.7 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.66 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.49 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.56 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.18 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.04 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.3 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.93 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.71 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.96 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.04 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  24.46 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  47.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  43.86 
 
 		 171 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.89 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  27.41 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.28 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.49 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  27.84 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  25.43 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  45.45 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  23.88 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.16 
 
 		 167 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.37 
 
 		 386 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>