169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0348 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  100 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  49.27 
 
 		 277 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  45.02 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  44.89 
 
 		 274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  47.41 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  42.44 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  45.69 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  36.06 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  30.48 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  31.85 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  32.72 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  32.09 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.32 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  30.48 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  30.86 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  30.48 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  31.97 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  32.08 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  32.23 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  32.6 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  28.09 
 
 		 273 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  27.88 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  27.84 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  29.43 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  27.61 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  29.47 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.46 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  29.08 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  33.1 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.26 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  27.78 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  29.43 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  29.79 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  27.01 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.57 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  30.26 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  25.71 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.11 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.43 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.35 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.07 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.7 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.27 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.37 
 
 		 190 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.76 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.29 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  24.28 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.8 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.75 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.49 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.49 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  23.74 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.29 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.42 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  23.23 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  25.57 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  23.4 
 
 		 169 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  23.23 
 
 		 189 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.55 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  26.63 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.45 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.16 
 
 		 175 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  22.41 
 
 		 172 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  24.43 
 
 		 188 aa  52.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  32.84 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.8 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.65 
 
 		 189 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.8 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.06 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.83 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.37 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  30.67 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  26.26 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  25.14 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.75 
 
 		 178 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.56 
 
 		 170 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.12 
 
 		 163 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  43.94 
 
 		 187 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  22.91 
 
 		 189 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  39.71 
 
 		 180 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1740  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.84 
 
 		 167 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.5 
 
 		 175 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25 
 
 		 176 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.32 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  24.19 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  29.87 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  24.49 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.98 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  23.17 
 
 		 192 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.6 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.86 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  29.44 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  38.78 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  23.56 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.89 
 
 		 206 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  42.65 
 
 		 172 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.77 
 
 		 1130 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>