More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0556 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  100 
 
 		 345 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  38.58 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  37.78 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  36.56 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.22 
 
 		 202 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.22 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.79 
 
 		 187 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.96 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.45 
 
 		 194 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.88 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.36 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.27 
 
 		 274 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.11 
 
 		 190 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  24.47 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  31.22 
 
 		 189 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  25.99 
 
 		 185 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.51 
 
 		 188 aa  90.1  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  25 
 
 		 275 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.64 
 
 		 188 aa  89.4  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.91 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  25.53 
 
 		 279 aa  89.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30.48 
 
 		 189 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28.79 
 
 		 189 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.35 
 
 		 188 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.44 
 
 		 189 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  22.63 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24.46 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  23.87 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  22.39 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.76 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25.53 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.1 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  22.66 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  26.2 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  31.68 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  23.5 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  26.17 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.63 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  22.82 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  25.23 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  27.83 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  21.86 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  24.52 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  22.19 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  25.3 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  24.46 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.11 
 
 		 176 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  22.02 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  24.02 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.25 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  25.7 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  21.86 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.12 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.12 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  24.85 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.08 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  21.95 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  23.1 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  26.43 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  23.24 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  22.7 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  22.86 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.13 
 
 		 263 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.83 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  22.39 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  28.63 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  27.14 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.47 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  22.78 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.37 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.08 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.27 
 
 		 166 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  21.82 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.27 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  25.76 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  25.76 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.78 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.05 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  25.76 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  25.52 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.64 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  25.1 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  25.76 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  27.49 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  23.68 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.49 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  27.49 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  26.23 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.44 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  26.32 
 
 		 254 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  28.98 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  26.23 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  27.49 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  26.23 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  29.74 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.44 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.33 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  26.05 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>