253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1195 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  100 
 
 
278 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  49.63 
 
 
279 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  46.18 
 
 
277 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  42.44 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  45.26 
 
 
273 aa  238  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  40.29 
 
 
274 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  43.87 
 
 
271 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  34.08 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  33.58 
 
 
274 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  32.83 
 
 
272 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  31.46 
 
 
273 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  34.83 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  32.97 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  32.45 
 
 
274 aa  141  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  33.81 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  35.02 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  32.58 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  29.21 
 
 
275 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  30.47 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  33.33 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  30.45 
 
 
263 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  30.48 
 
 
295 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  32.33 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  31.85 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  27.72 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  30.4 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.57 
 
 
272 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  32.72 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  29.52 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  28.46 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.57 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  30.29 
 
 
278 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  28.16 
 
 
278 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  29.39 
 
 
274 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  27.57 
 
 
272 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
275 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.37 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.15 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25.26 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.89 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.33 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.33 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.68 
 
 
345 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  24.05 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.5 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.08 
 
 
191 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.49 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.24 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.91 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.67 
 
 
202 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.72 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28.41 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.09 
 
 
185 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.59 
 
 
168 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.12 
 
 
188 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  24.21 
 
 
189 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  23.81 
 
 
189 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  27.75 
 
 
184 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.29 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.43 
 
 
62 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  23.81 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.16 
 
 
188 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  32.75 
 
 
189 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 
80 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  24.86 
 
 
188 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1418  glycyl-radical activating family protein  46.15 
 
 
315 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  22.84 
 
 
182 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  24.44 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.93 
 
 
62 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  21.16 
 
 
186 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  36.27 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000519227  hitchhiker  0.00000000000000416733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1846  putative PAS/PAC sensor protein  40.85 
 
 
572 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  45.45 
 
 
421 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0995  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
366 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  41.18 
 
 
580 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  35.9 
 
 
414 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  42.59 
 
 
443 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  35.96 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 
61 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.23 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  26.12 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2120  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 
62 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3544  glycyl-radical enzyme activating protein family  25.65 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  27.19 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.5 
 
 
172 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  26.12 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.73 
 
 
163 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.37 
 
 
177 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
61 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000461685  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 
357 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.33 
 
 
447 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  24.26 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
62 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  33.1 
 
 
239 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  23.43 
 
 
163 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.33 
 
 
447 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 
1130 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>