More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0886 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  41.52 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  27.27 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.55 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  26.9 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  30.71 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.35 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.17 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.03 
 
 		 272 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.03 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  27.36 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25.17 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  24.49 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.76 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.95 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  26.09 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  28.74 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  26.13 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  25.26 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  26.03 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  24.75 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  26.6 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  28.19 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  26.37 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  26.03 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  25.5 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  26.51 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  24.11 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  24.4 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25.26 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  25.8 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  24.66 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  25.35 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.85 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.24 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  24.75 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  21.52 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  23.39 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  22.87 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  26.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  26.3 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.568616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.13 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.05 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.16 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.62 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.98127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.78 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.37 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000311269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  28.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  27.4 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.43 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.03 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 392 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.48 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  46.3 
 
 		 792 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  35.48 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.12 
 
 		 186 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0035  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000757176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05970  4Fe-4S protein  40.98 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.526653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  24.24 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.1 
 
 		 519 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.56 
 
 		 196 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 592 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0654  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  38.82 
 
 		 654 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.558651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 		 657 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.86 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.37 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 1481 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 		 61 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  25.79 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1654  hydrogenases, Fe-only  37.04 
 
 		 659 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.357121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1969  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  43.64 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000637611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1596  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.3 
 
 		 996 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.94 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1890  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.9 
 
 		 124 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0163  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.92 
 
 		 656 aa  49.7  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.49 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  33.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0068  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 654 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.829089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 		 62 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4621  hydrogenase, Fe-only  37.14 
 
 		 527 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 593 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1277  Fe-hydrogenase large subunit family protein  35.05 
 
 		 493 aa  49.3  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0347  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  37.97 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 69 aa  49.3  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0232771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  36.23 
 
 		 612 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0890534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 		 898 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2698  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  45.76 
 
 		 587 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 990 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>