298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2624 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  54.74 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  55.84 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  41.54 
 
 
273 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  37.73 
 
 
272 aa  226  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  40.88 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  38.69 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  37.96 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  39.29 
 
 
274 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  38.83 
 
 
275 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  37.05 
 
 
274 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  37.96 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  38.04 
 
 
274 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  38.57 
 
 
263 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  36.86 
 
 
274 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  36 
 
 
262 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  33.82 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  34.07 
 
 
265 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  36.23 
 
 
275 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  35.64 
 
 
284 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.94 
 
 
277 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  35.66 
 
 
279 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  33.46 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  36.06 
 
 
275 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  35.48 
 
 
274 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  32.26 
 
 
278 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  34.67 
 
 
295 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  32.26 
 
 
282 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  36 
 
 
271 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  32.97 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  34.94 
 
 
273 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  33.21 
 
 
274 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.62 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  29.29 
 
 
273 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.69 
 
 
272 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.33 
 
 
272 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  27.5 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.6 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  27.36 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.67 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.77 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.23 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.14 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.2 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.53 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.73 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.93 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.43 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30.36 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  24.16 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.22 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.09 
 
 
165 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.92 
 
 
202 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.68 
 
 
183 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  29.21 
 
 
188 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.44 
 
 
170 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.18 
 
 
183 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.66 
 
 
166 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.99 
 
 
168 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  26.82 
 
 
189 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  24.74 
 
 
189 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.47 
 
 
176 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.41 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.12 
 
 
184 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.29 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.19 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.91 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.66 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.17 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.98 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.03 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  25.86 
 
 
189 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.32 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.17 
 
 
191 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.47 
 
 
184 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.47 
 
 
184 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.95 
 
 
167 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.81 
 
 
178 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.87 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.97 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.98 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.56 
 
 
172 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  28.72 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.26 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.53 
 
 
184 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  23.6 
 
 
171 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  24.71 
 
 
189 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.33 
 
 
191 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0704  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.51 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  26.97 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.41 
 
 
185 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  24.64 
 
 
197 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  27.81 
 
 
173 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.67 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.45 
 
 
215 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.23 
 
 
186 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  25.41 
 
 
182 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.34 
 
 
176 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  24.59 
 
 
246 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>