194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5783 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  100 
 
 		 254 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  95.67 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  75.52 
 
 		 247 aa  391  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  70.42 
 
 		 246 aa  362  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  70.59 
 
 		 249 aa  361  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  66.8 
 
 		 242 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  69.51 
 
 		 224 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  62.61 
 
 		 237 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  62.55 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  63.06 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  62.61 
 
 		 235 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  62.78 
 
 		 229 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  61.78 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  63.06 
 
 		 229 aa  294  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  64.41 
 
 		 242 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  63.96 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  63.96 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  61.74 
 
 		 242 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  58.64 
 
 		 231 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  54.55 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  53.3 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  52.7 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  52.72 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  52.31 
 
 		 236 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  50.45 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  46.61 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  51.3 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  50.45 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  44.44 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  48.36 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  47.75 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  45.66 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.6 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  42.04 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  43.24 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  41.82 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  40.53 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  40.81 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  40 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  38.46 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  38.22 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  39.82 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  38.01 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  36.84 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  40.2 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  37.9 
 
 		 221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  39.7 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  40 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.07 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  35.75 
 
 		 226 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  37.04 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  35.16 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  34.55 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  36.94 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  36.04 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  36.04 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.55 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  36.04 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  36.92 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  34.03 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  36.45 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  34.84 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  32.64 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  33.19 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.91 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  34.55 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.61 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.09 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  32 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  33.18 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  28.51 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.72 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  33.8 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.69 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  31.48 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  30.8 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.57 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  28.38 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.9 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.19 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  28.11 
 
 		 217 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.76 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.46 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.15 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  26.42 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.1 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.1 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.76 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.13 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.37 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.09 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.75 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.7 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  41.82 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.39 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  24.74 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.15 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>