278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3352 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  100 
 
 		 233 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  52.73 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  51.36 
 
 		 235 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  55.86 
 
 		 228 aa  244  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  50.45 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  50.91 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  52.61 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  50.91 
 
 		 229 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  50.45 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  54.13 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  52.75 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  50 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  50.7 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  48.91 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  49.09 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  49.09 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  49.3 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  48.64 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  48.83 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  48.64 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  47.14 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  47.51 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  45.45 
 
 		 242 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  48.36 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  46.43 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  43.05 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  48.6 
 
 		 246 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  48.17 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  45 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  42.86 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  44.7 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  43.89 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  45 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  44.6 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.55 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  43.44 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  43.66 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  46.03 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  43.58 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  43.26 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  43.44 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  43.26 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  44.44 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  40.44 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  40 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  41.63 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  42.11 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  41.47 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  41.47 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  37.5 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  34.76 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.46 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.01 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.97 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.05 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  34.86 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  35.75 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.91 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.91 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  31.36 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.43 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.2 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.65 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  33.64 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  33.79 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  35.45 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  33.04 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.19 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  34.68 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.74 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.54 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  31.53 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  32.02 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.33 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  31.25 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.65 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  32.9 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  30.36 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.14 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.89 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.82 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  29.6 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.33 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  29.33 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  31.14 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25.88 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.57 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.7 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.05 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.28 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  43.08 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  38.36 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  24.15 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.55 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  22.92 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  22.49 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  36.99 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>