235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3050 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  100 
 
 
242 aa  493  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  100 
 
 
242 aa  493  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  99.17 
 
 
242 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  91.32 
 
 
242 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  91.32 
 
 
239 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  70.4 
 
 
229 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  67.86 
 
 
229 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  66.22 
 
 
235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  68 
 
 
235 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  65.78 
 
 
235 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  64.41 
 
 
231 aa  314  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  61.11 
 
 
246 aa  304  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  64.41 
 
 
254 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  63.96 
 
 
254 aa  297  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  56.85 
 
 
249 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  58.11 
 
 
242 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  57.92 
 
 
247 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  58.95 
 
 
258 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  57.73 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  57.02 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  57.78 
 
 
236 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  54.5 
 
 
237 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  56.88 
 
 
236 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  54.15 
 
 
224 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  54.87 
 
 
239 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  54.3 
 
 
228 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  52.85 
 
 
245 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  48.85 
 
 
228 aa  225  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  49.54 
 
 
231 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  49.32 
 
 
224 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  48.64 
 
 
233 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  48.6 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  47.27 
 
 
223 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  44.64 
 
 
223 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.34 
 
 
221 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  45.29 
 
 
240 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  44.09 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  40.99 
 
 
221 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  44.39 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  41.89 
 
 
223 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  39.82 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  42.4 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  42.27 
 
 
228 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  42.99 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  42.99 
 
 
232 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  39.55 
 
 
226 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  39.06 
 
 
241 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  39.82 
 
 
226 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  45.28 
 
 
225 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.77 
 
 
232 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  41.07 
 
 
221 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  40.81 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  41.89 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  34.04 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.36 
 
 
232 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  39.01 
 
 
235 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  35.84 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.33 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  37.79 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  39.46 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  39.46 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  37.33 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  38.18 
 
 
220 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  39.01 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  36.41 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  39.29 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  34.19 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  33.93 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  33.48 
 
 
231 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  35.05 
 
 
244 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.55 
 
 
224 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  31.08 
 
 
220 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  32.76 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.13 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  33.78 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.98 
 
 
228 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  30.97 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  32.31 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.03 
 
 
227 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  31.67 
 
 
229 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  33.33 
 
 
225 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.14 
 
 
234 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  31.65 
 
 
217 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.82 
 
 
235 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.14 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  28.7 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.73 
 
 
270 aa  95.5  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.27 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.73 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  51.85 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.64 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.8 
 
 
176 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  52 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.44 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.63 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  26.7 
 
 
191 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.75 
 
 
191 aa  55.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.37 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  41.67 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.96 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>