147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2473 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  53.33 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  45.83 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.73 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.36 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  35.19 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.59 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  37.38 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  34.23 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  32.43 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.18 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  34.5 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  32.89 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  35.27 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  34.82 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  31.46 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.17 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  32.6 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  30.84 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  32.73 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.73 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  33.04 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  29.28 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  32.27 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  31.22 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  32.89 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  32.89 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  29.91 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  31.58 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  32.46 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  30.14 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.39 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  29.07 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  30.7 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  31.34 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  32 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  32.71 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.19 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  30.09 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  30.53 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  32.24 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  32.09 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  27.68 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  32.59 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.05 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  30.8 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  30.45 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  29.17 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  30.37 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  31.11 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  30.09 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  29.3 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  31.34 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  29.63 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  32.24 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  31.36 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  31.36 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  30.87 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  27.06 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  28.24 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.09 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  28.38 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  31.56 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  28.5 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  28.04 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  29.28 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  29.65 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  28.04 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.45 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  29.6 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.69 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.82 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  25.68 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  26.89 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  29.46 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  26.42 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  26.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  31.8 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  27.95 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  29.41 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  31.55 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  31.22 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  23.14 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  25.88 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  24.56 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.68 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  24.32 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  25.32 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  28.51 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.73 
 
 		 174 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  39.74 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.6 
 
 		 350 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.59 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  40.35 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  25.94 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  47.83 
 
 		 178 aa  48.9  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.35 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  32.31 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.15 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.88 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>