194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8469 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  45.29 
 
 
235 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  44.39 
 
 
235 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  45.78 
 
 
235 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  47.51 
 
 
224 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  46.73 
 
 
236 aa  201  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  44.09 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  44.14 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  44.49 
 
 
228 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  45.29 
 
 
242 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  45.29 
 
 
242 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  45.74 
 
 
242 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.44 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  44.14 
 
 
229 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  44.84 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  44.44 
 
 
239 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  42.79 
 
 
249 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  40.97 
 
 
237 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  41.78 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  39.63 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  42.92 
 
 
228 aa  181  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  44 
 
 
246 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  40.09 
 
 
223 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  42.2 
 
 
226 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  42.6 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  41.15 
 
 
247 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  40.53 
 
 
254 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  40.53 
 
 
254 aa  177  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  41.98 
 
 
233 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  43.98 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  39.82 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  39.37 
 
 
224 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  40.55 
 
 
228 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  41.12 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  39.73 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  37.67 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  37.99 
 
 
258 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  37.44 
 
 
257 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  37.39 
 
 
223 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.27 
 
 
231 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  37.38 
 
 
226 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  39.37 
 
 
245 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  35.09 
 
 
235 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  34.72 
 
 
223 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  37.44 
 
 
221 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  38.71 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.35 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  36.92 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  38.89 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  31.6 
 
 
221 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  37.5 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  34.26 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  35.24 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  35.24 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.72 
 
 
222 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.72 
 
 
222 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  32.88 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  34.23 
 
 
220 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.2 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  26.94 
 
 
220 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.58 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  32.13 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.66 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  29.73 
 
 
237 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  31.67 
 
 
232 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  32.24 
 
 
215 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.45 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  28.24 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  32.34 
 
 
218 aa  92  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.31 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  27.59 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  30.04 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.77 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.48 
 
 
270 aa  88.6  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.03 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  29.96 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  30.36 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  30.94 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  26.27 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  30.97 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.91 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  30.22 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  27.41 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.27 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.75 
 
 
345 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.72 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  44.23 
 
 
165 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.57 
 
 
252 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.07 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  52.38 
 
 
177 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  50 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.6 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  46.67 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.3 
 
 
191 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  47.92 
 
 
174 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.17 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>