126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6296 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  51.13 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  45.45 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  46.7 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  46.43 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  46.82 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  43.18 
 
 
230 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  45.21 
 
 
231 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  42.92 
 
 
244 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  45.66 
 
 
230 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  42.67 
 
 
241 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  40.09 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  34.93 
 
 
228 aa  141  8e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  34.96 
 
 
235 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  35.94 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  34.26 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  35.32 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  31.51 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  35.05 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  33.03 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  34.3 
 
 
231 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  31.56 
 
 
257 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.56 
 
 
220 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  32.88 
 
 
231 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  30.66 
 
 
223 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  34.1 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  32.56 
 
 
254 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  34.68 
 
 
237 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  32.41 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  33.82 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  32.09 
 
 
254 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  32.57 
 
 
229 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  33.98 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  32.43 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  33.33 
 
 
228 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  33.18 
 
 
224 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  33.17 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  31.48 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  33.64 
 
 
223 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  31.22 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  33.33 
 
 
224 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  32.57 
 
 
236 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  29.78 
 
 
242 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  29.78 
 
 
242 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  32.71 
 
 
226 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  30.84 
 
 
242 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  31.16 
 
 
240 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  33.8 
 
 
221 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  33.65 
 
 
233 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.72 
 
 
225 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  33.18 
 
 
232 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  27.65 
 
 
225 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  31.02 
 
 
239 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  29.44 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.19 
 
 
235 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  32.41 
 
 
221 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  27.23 
 
 
237 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  33.33 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.83 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  31.19 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  29.3 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  31.63 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  28.57 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  30.09 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  29.25 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  31.48 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.77 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  29.68 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  29.58 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  27.65 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.89 
 
 
234 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  29.91 
 
 
222 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  29.91 
 
 
222 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.54 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.64 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  27.36 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.89 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  29.44 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  26.82 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  26.11 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  24.55 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  28.16 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  28.71 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  28.36 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  28.23 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  22.75 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  22.9 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  40.79 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.43 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  45.65 
 
 
169 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.38 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0089  hypothetical protein  56.76 
 
 
43 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.57 
 
 
278 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  40.68 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.88 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  38.18 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  38.46 
 
 
210 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.33 
 
 
345 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4002  hypothetical protein  41.18 
 
 
867 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>