158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1917 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  100 
 
 
225 aa  466  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  45.66 
 
 
223 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  45.41 
 
 
223 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  45.45 
 
 
223 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  42.15 
 
 
221 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  42.13 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  42.59 
 
 
235 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.26 
 
 
233 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  43.69 
 
 
233 aa  175  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  40.74 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  42.59 
 
 
229 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  43.06 
 
 
235 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  43.13 
 
 
220 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  44.08 
 
 
219 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  44.66 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  44.71 
 
 
225 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  42.79 
 
 
242 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  40.91 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  42.4 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  42.4 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  42.4 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  38.57 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  37.67 
 
 
240 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  39.53 
 
 
231 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  38.22 
 
 
226 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  39.35 
 
 
237 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  38.21 
 
 
236 aa  158  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  39.45 
 
 
247 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  38.91 
 
 
221 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  38.89 
 
 
249 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  39.35 
 
 
224 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  40.93 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  37.72 
 
 
242 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  36.84 
 
 
254 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  37 
 
 
254 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  37.73 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  36.62 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  38.81 
 
 
246 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  36.61 
 
 
224 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  35.71 
 
 
223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  38.18 
 
 
236 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  36.57 
 
 
228 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  34.4 
 
 
226 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  39.09 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  34.42 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  34.11 
 
 
221 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  38.18 
 
 
258 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  35.38 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  35.38 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  37.33 
 
 
239 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  32.72 
 
 
221 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  34.88 
 
 
221 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.91 
 
 
222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  32.11 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  35.75 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  34.39 
 
 
231 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.42 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  34.25 
 
 
232 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.8 
 
 
230 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  33.79 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  33.18 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32.89 
 
 
235 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.32 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  31.53 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  33.49 
 
 
232 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.26 
 
 
225 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31.46 
 
 
231 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.88 
 
 
244 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.22 
 
 
224 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  29.29 
 
 
270 aa  98.2  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  29.09 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  28.31 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.77 
 
 
228 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  29.78 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  29.58 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  27.91 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.94 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  28.9 
 
 
241 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  31.63 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.25 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.35 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  30.84 
 
 
225 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.26 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  30.8 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  24.55 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  28.76 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.07 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  42.62 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.53 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  42.31 
 
 
165 aa  52  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  47.27 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  22.49 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  27.48 
 
 
186 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  32.26 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  47.17 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  26.72 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>