231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5984 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  100 
 
 		 228 aa  470  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  69.6 
 
 		 226 aa  338  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  46.88 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  45.73 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  48.15 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  46.3 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  44.44 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  43.95 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  41.74 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  41.33 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  42.15 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  43.05 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  42.59 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  41.55 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  40.55 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  40.27 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  40.64 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  39.91 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  40.53 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  42.27 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  40.43 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  42.27 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  42.27 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  40.25 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  39.73 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  41.95 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  37 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  42.47 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  40.36 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  39.91 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  39.41 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  41.01 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  38.01 
 
 		 254 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  41.82 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  37.33 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  36.96 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  38.25 
 
 		 247 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  37.27 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  33.78 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  32.11 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  37.73 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  38.81 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  35.47 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  37.9 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  35.64 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  37.5 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  37.5 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  37.04 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  35.78 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  35.5 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  34.52 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  33.78 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  34.26 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  34.56 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  34.56 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  32.56 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  31.74 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  34.84 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  32.6 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  30.36 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  29.73 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  34.25 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  35.81 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  33.03 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.71 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  32.11 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  31.09 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  32.75 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30.53 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  32.57 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.88 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  29.15 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.11 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  31.86 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30.77 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  31.94 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  32.33 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  27.93 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  29.68 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.78 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.47 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.45 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.11 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  29.47 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  26.58 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.98 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.29 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.54 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.74 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.96 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.68 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.59 
 
 		 334 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.14 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.23 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.88 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.15 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.31 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>