More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5306 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  99.55 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  99.55 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  73.3 
 
 
221 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  73.97 
 
 
221 aa  344  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  73.97 
 
 
221 aa  342  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  50.22 
 
 
221 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  47.06 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  42.73 
 
 
223 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  46.85 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  45 
 
 
226 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  41.28 
 
 
235 aa  167  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  35.14 
 
 
228 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  41.51 
 
 
225 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  38.58 
 
 
233 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  39.73 
 
 
229 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  38.84 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  37.16 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  39.27 
 
 
242 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.75 
 
 
231 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  38.81 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  37.22 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  37.84 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  39.09 
 
 
220 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  35.29 
 
 
247 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  33.49 
 
 
221 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  36.57 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  37.79 
 
 
239 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  40.18 
 
 
242 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  38.01 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  34.91 
 
 
225 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  35.09 
 
 
231 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  35.65 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  38.12 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  36.41 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  39.82 
 
 
239 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  32.88 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  33.94 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  34.86 
 
 
254 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  34.43 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  39.29 
 
 
242 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  34.98 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.45 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  35.59 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.67 
 
 
257 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  35.65 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  36.04 
 
 
254 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  38.84 
 
 
242 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  38.84 
 
 
242 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.59 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  34.56 
 
 
230 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  34.2 
 
 
240 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  37.19 
 
 
228 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  37.04 
 
 
228 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  34.42 
 
 
226 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  34.08 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  37.5 
 
 
224 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  34.35 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.26 
 
 
232 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  30.77 
 
 
223 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  32.72 
 
 
232 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.64 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.43 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32.46 
 
 
235 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.16 
 
 
215 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  31.84 
 
 
241 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  39.55 
 
 
227 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  34.84 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  34.84 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.24 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  31.86 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  36.49 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.57 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  36.23 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  35.51 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.36 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  36.96 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.14 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.09 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  29.44 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.41 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  26.01 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.7 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.22 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.23 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  26.57 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  24.44 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  24.19 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  36.79 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  49.06 
 
 
190 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  47.62 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  44.32 
 
 
173 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  48.98 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  50.98 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  47.06 
 
 
167 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  39.39 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  49.02 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.9 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  50 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  51.02 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>