More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0545 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  60.36 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  65.24 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  56.65 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  56.89 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  52.73 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  53.29 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  48.63 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  47.62 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  45.29 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.18 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  37.75 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.93 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.97 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  39.63 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  39.1 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.56 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  38.16 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  34.87 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  37.91 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  39.1 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  38.46 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  35.76 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.55 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.03 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  31.82 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.37 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.22 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  34.19 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  31.33 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.34 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.9 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.54 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.21 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  35.22 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.69 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.69 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  38.46 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  35.22 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.73 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.05 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  39.32 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  39.32 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  30.6 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  35.57 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  38.46 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.79 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.12 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.82 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.11 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.77 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.52 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  33.09 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  31.11 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.25 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.38 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.71 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  33.73 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.64 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.19 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  33.67 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  36.96 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.72 
 
 		 191 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  34.46 
 
 		 350 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.86 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.95 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.71 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.72 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  31.54 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.09 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.9 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.31 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  36.42 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.45 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  29.08 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.99 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  34.42 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  33.53 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.91 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  31.98 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.99 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.22 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  37.27 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.21 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  24.29 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.54 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  31.98 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  29.74 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.34 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24.85 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  31.4 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.23 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>