More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  100 
 
 		 174 aa  364  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  46.75 
 
 		 176 aa  164  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  41.52 
 
 		 176 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  39.08 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  39.16 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  40.37 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.48 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.58 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.95 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  35.23 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.73 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.86 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  32.16 
 
 		 215 aa  84.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28.57 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.63 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.42 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.65 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.47 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.94 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.54 
 
 		 329 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.52 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.06 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.98 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  34.44 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  31.71 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  32.9 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.82 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.98 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  32.76 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.07 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  31.01 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  33.55 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.11 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.18 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.17 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.29 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.92 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  31.79 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.1 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.11 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.13 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  32.9 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.38 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.51 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.69 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.25 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.57 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.65 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  28.57 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  25.77 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  33.33 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  29.7 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.12 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.31 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.33 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.92 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  30.65 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.25 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  27.98 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  32.68 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.29 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  28.85 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  27.22 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.32 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.56 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  28.02 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.45 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.11 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.78 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  28.64 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  32.73 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.22 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  27.71 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  25.53 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  30.25 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  25.64 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.03 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  25.64 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.21 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.92 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  32.68 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.14 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.35 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  25.48 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.47 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.47 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  28.22 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  30.23 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.22 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  27.45 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  27.45 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  28.92 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  27.45 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.11 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>