More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1628 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  41.79 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  41.67 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  34.38 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  32.62 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  37.71 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  38.73 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  35.68 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  38.83 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  32.61 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  33.68 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  32.14 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  32.68 
 
 		 185 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  37.01 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  30.43 
 
 		 182 aa  85.1  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  32.03 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  32.09 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.36 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  32.03 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  31.76 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  33.53 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  31.37 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  36.42 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  30.36 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  29.34 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  30.49 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28.4 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  33.91 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  29.76 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  29.76 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  29.76 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  29.11 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  28.88 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  32.45 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  29.81 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  30.3 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  31.95 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  33.72 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  27.81 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  29.81 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  29.81 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  30.65 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  30.3 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  28.27 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  31.69 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  28.8 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  33.1 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.21 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  28.04 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  31.72 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  32.72 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.49 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  30.77 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  28.27 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  29.41 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  32.73 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  33.15 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  26.26 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  31.28 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  27.98 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  29.19 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  32.45 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  28.65 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  29.81 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  28.4 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  31.76 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  32.54 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>