More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1738 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  99.5 
 
 
201 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  99.5 
 
 
201 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  99.5 
 
 
201 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  99.5 
 
 
201 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  99.5 
 
 
201 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  96.5 
 
 
201 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  84.5 
 
 
201 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  84.5 
 
 
201 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  84.5 
 
 
201 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  83 
 
 
207 aa  340  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  84.5 
 
 
201 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  83.25 
 
 
201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  82 
 
 
201 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  78.17 
 
 
205 aa  324  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  76.14 
 
 
197 aa  317  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  76.14 
 
 
205 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  50.76 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  53.27 
 
 
200 aa  188  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  44.16 
 
 
213 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  42.13 
 
 
200 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  43.81 
 
 
201 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  41.49 
 
 
200 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  44.61 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  45.08 
 
 
214 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  40.1 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  40.1 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  40.1 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  39.15 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.32 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.3 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  35.64 
 
 
191 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  40.76 
 
 
199 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  35.29 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  38.95 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  40.66 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  40.44 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  35.9 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  36.22 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  40.31 
 
 
315 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  39.7 
 
 
199 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  38.69 
 
 
199 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  38.69 
 
 
199 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  36.59 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  37.16 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  41.3 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  41.9 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  38.8 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  37.7 
 
 
199 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  36.79 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  37.5 
 
 
197 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  38.5 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  40.11 
 
 
199 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  37.84 
 
 
198 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  46.01 
 
 
233 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  38.67 
 
 
199 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
197 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  36.88 
 
 
200 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  39.77 
 
 
187 aa  104  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  38.3 
 
 
194 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.35 
 
 
195 aa  104  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.94 
 
 
197 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.64 
 
 
199 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  36.31 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  37.87 
 
 
198 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  42.65 
 
 
151 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  46.63 
 
 
209 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  46.63 
 
 
209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  35.8 
 
 
200 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  34.07 
 
 
321 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  40.45 
 
 
192 aa  98.6  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  33.52 
 
 
321 aa  98.2  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.07 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  36.07 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.62 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  34.07 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  36.02 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.53 
 
 
184 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  34.2 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  34.41 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.87 
 
 
194 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  33.76 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.01 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  34.59 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  37.82 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.01 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  31.25 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.42 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.11 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.38 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  30.2 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.04 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.16 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.37 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  36 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.38 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.38 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.31 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.92 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>