More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2261 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  100 
 
 
201 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  49.5 
 
 
200 aa  214  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  49.73 
 
 
213 aa  194  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  48.24 
 
 
214 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  44.97 
 
 
201 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  43.16 
 
 
223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  43.81 
 
 
201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  41.67 
 
 
201 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  43.88 
 
 
205 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  43.39 
 
 
207 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  41.67 
 
 
201 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  41.67 
 
 
201 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  42.78 
 
 
205 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  42.86 
 
 
201 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  45.26 
 
 
197 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  41.21 
 
 
203 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  45.26 
 
 
197 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  45.26 
 
 
197 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  42.27 
 
 
197 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  41.8 
 
 
201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  41.8 
 
 
201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  40 
 
 
197 aa  148  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  42.19 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  41.8 
 
 
197 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  39.57 
 
 
189 aa  141  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  41.8 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  40.74 
 
 
198 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  40.23 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  41.76 
 
 
191 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  42.27 
 
 
199 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  41.76 
 
 
195 aa  134  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  39.89 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  38.81 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  42.08 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  38.74 
 
 
198 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  40.44 
 
 
190 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  42.19 
 
 
315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  40.94 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  39.33 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  38.74 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  43.48 
 
 
151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  38.3 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  35.42 
 
 
200 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.18 
 
 
199 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  37.23 
 
 
199 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  38.83 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  38.74 
 
 
199 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  39.15 
 
 
198 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  40.21 
 
 
199 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  40.21 
 
 
199 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  42.63 
 
 
233 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  39.69 
 
 
199 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  38.86 
 
 
197 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  41.58 
 
 
192 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  36.84 
 
 
199 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  36.65 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  39.57 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  36.22 
 
 
204 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  33.15 
 
 
195 aa  115  6e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  44.21 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  44.32 
 
 
209 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  35.64 
 
 
203 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  34.07 
 
 
203 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  32.97 
 
 
203 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  37.84 
 
 
194 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  31.89 
 
 
203 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  36.31 
 
 
321 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  36.31 
 
 
321 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  33.85 
 
 
195 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  36.52 
 
 
199 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
330 aa  95.1  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  31.49 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  36.21 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.48 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.44 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.98 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  32.4 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.65 
 
 
188 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.87 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.15 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.96 
 
 
170 aa  72  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.11 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.67 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.27 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.52 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.22 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.03 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.65 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.79 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.35 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.42 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.17 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  31.07 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  33.13 
 
 
184 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>