283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5012 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  100 
 
 
191 aa  396  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  50.83 
 
 
189 aa  194  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  36.7 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.22 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  35.68 
 
 
200 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.77 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  37.63 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  36.99 
 
 
197 aa  124  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  41.76 
 
 
201 aa  124  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  39.78 
 
 
197 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  35.64 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  36.7 
 
 
201 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  36.7 
 
 
201 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.17 
 
 
201 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  36.7 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  35.11 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.17 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  35.64 
 
 
201 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.36 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  35.33 
 
 
199 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.45 
 
 
205 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  37.22 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  34.39 
 
 
205 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  37.35 
 
 
200 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.9 
 
 
199 aa  114  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  36.78 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  33.68 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  34.39 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  36.76 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  34.36 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  34.36 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  34.36 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  33.16 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  37.87 
 
 
198 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  33.15 
 
 
199 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  36.11 
 
 
199 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  40.91 
 
 
233 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  35.59 
 
 
197 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  35.03 
 
 
197 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  34.76 
 
 
198 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  32.82 
 
 
197 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  37.89 
 
 
204 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  40.8 
 
 
209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  33.33 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  30.48 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  40.34 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  32.07 
 
 
315 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  34.18 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.3 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  34.03 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  32.39 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  31.02 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  31.43 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  31.43 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  32.58 
 
 
210 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  33.7 
 
 
195 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  31.11 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  30.54 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  34.83 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  30.56 
 
 
205 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.98 
 
 
330 aa  88.6  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  29.95 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  32.52 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  29.95 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  29.41 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  27.37 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  31.75 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.98 
 
 
321 aa  84.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.7 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.98 
 
 
321 aa  84.3  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  31.38 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  28.74 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  28.26 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.68 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  28.25 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  37.59 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.49 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.76 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.68 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.57 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.26 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.55 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.41 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.33 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.6 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.95 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.76 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.74 
 
 
170 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.86 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  24.29 
 
 
217 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.19 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.61 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>