195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0458 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  48.37 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  47.83 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  47.83 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  48.62 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  46.11 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  40.64 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  43.89 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  41.4 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.37 
 
 		 203 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  38.76 
 
 		 315 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  36.79 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  35.29 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.13 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  35.48 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.08 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  37.04 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  35.6 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  33.51 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  37.04 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  35.6 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  35.6 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.51 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  35.08 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  36.9 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  33.16 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  32.8 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  36.31 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  38.37 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.25 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  34.64 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  31.35 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  33.85 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  35.48 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.61 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  31.02 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  36.63 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.78 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  34.62 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  34.21 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  34.08 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  33.68 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  33.68 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  33.68 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  34.08 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  33.33 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  29.95 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  30.22 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  33.51 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  36.46 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  28.42 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  34.29 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  32.81 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  34.55 
 
 		 321 aa  88.6  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  35.64 
 
 		 192 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  34.55 
 
 		 321 aa  88.2  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.35 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  31.35 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  33.71 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  32.96 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  31.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  29.12 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  29.89 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  29.67 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  28.26 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  36.46 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  30 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  32.07 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  29.1 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  30 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  35.36 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  32.9 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  28.16 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.96 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  29.92 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  31.1 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  26.89 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  26.64 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  26.89 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  26.17 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  26.42 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  26.42 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  26.42 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  27.36 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  28.98 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.03 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5658  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.23 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>