204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3919 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  100 
 
 
197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  93.91 
 
 
197 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  87.82 
 
 
197 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  82.23 
 
 
197 aa  337  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  82.23 
 
 
197 aa  337  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  81.22 
 
 
197 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  64.29 
 
 
198 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  58.97 
 
 
200 aa  241  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  56.12 
 
 
200 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  51.28 
 
 
199 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  51.3 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  53.12 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  55.96 
 
 
199 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  54.92 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  51.81 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  56.48 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  53.61 
 
 
198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  52.63 
 
 
204 aa  207  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  52.82 
 
 
195 aa  204  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  50 
 
 
203 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  52.11 
 
 
205 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  47.96 
 
 
199 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  49.49 
 
 
199 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  54.17 
 
 
233 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  55.73 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  48.42 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  46.07 
 
 
189 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  54.21 
 
 
209 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  52.51 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  45.26 
 
 
203 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  44.21 
 
 
203 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  46.45 
 
 
212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  41.88 
 
 
199 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  47.78 
 
 
213 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  46.84 
 
 
192 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  40.44 
 
 
190 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  42.78 
 
 
198 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  41.58 
 
 
201 aa  128  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  35.35 
 
 
203 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  38.38 
 
 
189 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  37.5 
 
 
315 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  36.41 
 
 
200 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  36.22 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  40.57 
 
 
200 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  36.13 
 
 
197 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  38.07 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.79 
 
 
200 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  38.07 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.44 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  37.56 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  42.86 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  36.04 
 
 
201 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  35.71 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  36.04 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  36.04 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  35.71 
 
 
197 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.04 
 
 
201 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  36.98 
 
 
201 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  35.68 
 
 
199 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  35.68 
 
 
199 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  35.59 
 
 
191 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  35.14 
 
 
199 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  35.52 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.91 
 
 
187 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  32.45 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  32.63 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  37.41 
 
 
151 aa  94.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  32.04 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  36.59 
 
 
200 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  33.14 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.57 
 
 
321 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  30.68 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  30.67 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.42 
 
 
330 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  28.04 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.25 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  31.4 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.86 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.44 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.13 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.57 
 
 
180 aa  62.8  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.14 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.87 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  27.42 
 
 
172 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.25 
 
 
174 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.94 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.3 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1868  nitroreductase  28.74 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.047997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  27.89 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.91 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>