213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1391 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  87.82 
 
 		 197 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  86.29 
 
 		 197 aa  362  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  84.26 
 
 		 197 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  83.25 
 
 		 197 aa  343  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  83.25 
 
 		 197 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  61.73 
 
 		 198 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  56.41 
 
 		 200 aa  230  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  54.08 
 
 		 200 aa  218  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  52.58 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  52.06 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.51 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  54.74 
 
 		 204 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  55.21 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  56.77 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  51.55 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  53.89 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  50.52 
 
 		 203 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  53.16 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.52 
 
 		 199 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  51.81 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  50.53 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  55.21 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  47.96 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  48.97 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  55.73 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  46.84 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  46.84 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  54.21 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  44.21 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  50.84 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  43.98 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  46.15 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  46.39 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  46.81 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  41.34 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  43.16 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.37 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  39.68 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  40.57 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  34.87 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  38.27 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  38.27 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  37.76 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  35.2 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  36.73 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  36.22 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  37.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  37.43 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  36.73 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  36.73 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  36.73 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  36.9 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  36.36 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  34.55 
 
 		 315 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.73 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  34.21 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  43.43 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  37.31 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.94 
 
 		 214 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  36.81 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  32.82 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  34.44 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.61 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  33.51 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  38.12 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.83 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  30.53 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.95 
 
 		 321 aa  88.2  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.72 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  32.39 
 
 		 321 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  33.51 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  28.88 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.65 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.09 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.59 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.9 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.82 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.79 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.11 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.2 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.68 
 
 		 170 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.32 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.06 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.33 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.22 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.49 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  28.1 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.09 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.56 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.96 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>