219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3370 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  53.12 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  51.27 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  52.36 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  50.52 
 
 		 197 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  50.52 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  49.48 
 
 		 197 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  48.69 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  48.96 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  48.96 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  48.42 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  48.4 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  50.79 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  52.63 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  45.79 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  46.15 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.18 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  45.96 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  45.64 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  53.16 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  52.11 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  43.98 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  44.04 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  43.23 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  40.53 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  42.11 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  39.8 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  39.29 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  38.27 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  40.53 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  44.26 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  44.69 
 
 		 214 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  39.27 
 
 		 199 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  44.02 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  41.67 
 
 		 192 aa  140  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  40.4 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  38.98 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  41.18 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  39.18 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  35.9 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  40.64 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  38.38 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  43.26 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  34.39 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  37.77 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  38.38 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  36.36 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  39.64 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.3 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  35.75 
 
 		 315 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  34.21 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  35.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  36.17 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  35.26 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  32.8 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  34.57 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  34.54 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  34.59 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  35.95 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  34.59 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  34.27 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  34.41 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  35.88 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.15 
 
 		 330 aa  84.7  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  30.65 
 
 		 321 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  30.11 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.3 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.97 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  31.64 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  26.59 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  26.37 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  33.76 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  33.72 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.95 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.92 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  28.03 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.97 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.37 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.45 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  46.94 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.33 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  25.5 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  51.02 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.79 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  27.01 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  48 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  30.2 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1605  nitroreductase  27.98 
 
 		 330 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.690358  normal  0.842537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>