249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0289 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.44 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  42.19 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  45.74 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  42.08 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  42.08 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  41.53 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  40.44 
 
 		 197 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  42.08 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  41.94 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  40.44 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  42.7 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.02 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  41.94 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  41.34 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  42.46 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  39.08 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  41.44 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  42.86 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  39.68 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  41.62 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  44.09 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  41.53 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  40.54 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  40.76 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  40 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  40.22 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  39.27 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  46.52 
 
 		 233 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  43.75 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  41.71 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  36.41 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  45.45 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  36.41 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  40.44 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  45.99 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  35.87 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  37.11 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  38.8 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  39.25 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  36.41 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  39.41 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  38.17 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  39.15 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  40 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  37.63 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  38.17 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  38.17 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  38.17 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  38.17 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.7 
 
 		 214 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  40.46 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  36.56 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  41.53 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  40 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  34.73 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.63 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  33.7 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  36.48 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.33 
 
 		 330 aa  93.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  34.32 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  36.84 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  43.31 
 
 		 151 aa  91.3  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  30.54 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.61 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.8 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  35.33 
 
 		 315 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  38.65 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  38.65 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  38.92 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  35.33 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  37.42 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  34.39 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  33.76 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  35.71 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  29.3 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  27.68 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.19 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  25.53 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  25.53 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.53 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.26 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  23.94 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  31.85 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  24.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.3 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.28 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.25 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.45 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>