215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5063 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  52.79 
 
 		 200 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  54.12 
 
 		 198 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  52.33 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  51.28 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  55.96 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  51.28 
 
 		 197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  50.51 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  50.77 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  50.77 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  50.77 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  52.82 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  50.52 
 
 		 199 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  50.77 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  50 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  51.03 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  48.97 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  50.52 
 
 		 189 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  47.72 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  52.36 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  48.96 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  50 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  47.4 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  48.96 
 
 		 203 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  48.7 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  45.18 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  45.74 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  46.84 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  49.48 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  52.49 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  50 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  50 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  44.44 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  48.35 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  42.33 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  41.18 
 
 		 213 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  40.54 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  36.84 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  40.54 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  38.89 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  42.78 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  42.16 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  40 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  39.6 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  39.46 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  40.54 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  39.66 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  37.36 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  38.82 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  38.83 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.11 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.36 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  34.86 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.63 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  35.26 
 
 		 315 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  39.43 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  38.04 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  37.5 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  34.55 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  37.5 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  44.19 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  32.82 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  36.46 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  36.07 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  38.29 
 
 		 200 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  37.65 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  34.25 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  33.54 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 		 330 aa  86.3  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  32.9 
 
 		 151 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.14 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  32.16 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  30.05 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  31.58 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.34 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  28.11 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.61 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.03 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.77 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  34 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.95 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.22 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.87 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.02 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.78 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.89 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  27.03 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.49 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  26.97 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>