More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2000 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  49.21 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  53 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  49.73 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  47.18 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  48.37 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  48.37 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  48.37 
 
 		 197 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  47.78 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  48.33 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  46.81 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  45.36 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  44.16 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  44.85 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  44.33 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  44.33 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  43.37 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  45.31 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  44.74 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  43.81 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  39.46 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  44.33 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  45.9 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  45.36 
 
 		 197 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  43.81 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  43.92 
 
 		 198 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  45.45 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  44.62 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  43.22 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  50.72 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  37.76 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  43.32 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  43.72 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  41.41 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  39.59 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  36.7 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  44.57 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  44.07 
 
 		 315 aa  134  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.4 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  40.54 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  41.18 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  40 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  40.78 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  40.74 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  40.22 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  40.31 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  41.71 
 
 		 190 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  39.01 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  39.46 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  38.38 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  47.75 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  41.4 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  39.58 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  40.11 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  47.75 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  45.05 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  38.62 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.91 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  39.56 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  47.19 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  40.64 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  41.27 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  41.27 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  40.74 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  36.6 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  36.59 
 
 		 321 aa  104  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  36.08 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  35.98 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  39.15 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 330 aa  101  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  43.43 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  31.94 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.52 
 
 		 170 aa  89.4  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  39.13 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  36.26 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  35.56 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  26.49 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  35.76 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.57 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  25.5 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.98 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.32 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.89 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.11 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.05 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.26 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.67 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.8 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.96 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.15 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.98 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.84 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>