112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0589 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  36.22 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  40.24 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  37.16 
 
 		 315 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  39.13 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  31.89 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  38.38 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  38.38 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  38.38 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  40.74 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  36.42 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  33.78 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  31.02 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  30.56 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  30 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  31.52 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  34.59 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  34.59 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  28.88 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  33.14 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  31.05 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  29.51 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  28.89 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  31.15 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  32.98 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  31.15 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  32.5 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  31.21 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  32.91 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  31.21 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  28.57 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.91 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  31.65 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  30.26 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  31.21 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  28.89 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  41.27 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  28.04 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  28.42 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  29.19 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  27.96 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  27.96 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  30.46 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  27.96 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.76 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  27.78 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  29.17 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  28.89 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  32.52 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  28.48 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  29.44 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  34.95 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  27.32 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  26.79 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  31.21 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  34.41 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  33.87 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.11 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  31.74 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  31.87 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  29.82 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  29.84 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  30.06 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  32.79 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  25.84 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  28.99 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  31.45 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  30.26 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  32.28 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  30.16 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  30.89 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  31.85 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.43 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.28 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.6 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  32.24 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  23.84 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.99 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  24.58 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  24.58 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  24.07 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.07 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  25.14 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.62 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  25.6 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  24.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  25.83 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  24.14 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.35 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.01 
 
 		 321 aa  45.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  24.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  24.14 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>