190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1518 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  100 
 
 
197 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  55.28 
 
 
217 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  45.83 
 
 
192 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  46.81 
 
 
193 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  50 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  44.44 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  45.26 
 
 
192 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  43.48 
 
 
196 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  45.16 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  41.58 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  40.21 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  40.74 
 
 
192 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  40.43 
 
 
191 aa  128  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  34.92 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.45 
 
 
386 aa  101  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.89 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.98 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.95 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.71 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.48 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.72 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.1 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.11 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.59 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.38 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.42 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.82 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.74 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.87 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.89 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.38 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.12 
 
 
188 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.27 
 
 
186 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  30.43 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.17 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.65 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.44 
 
 
287 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  29.89 
 
 
178 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  27.04 
 
 
274 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  24.02 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.38 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.22 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.82 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.22 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  29.11 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.97 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1363  nitroreductase family protein  24.34 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  26.04 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.29 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.78 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.25 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  26.52 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  26.52 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.67 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.27 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  29.07 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.6 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  28.73 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  27.52 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  22.39 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  25.93 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  27.1 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  30.22 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  26.35 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  30.26 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  22.46 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.99 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  22.99 
 
 
212 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.7 
 
 
185 aa  52  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
201 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  25.42 
 
 
200 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  26.46 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  22.46 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  20.54 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  28.1 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  26.32 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.82 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  21.93 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.2 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.37 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  27.68 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  32.24 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  21.93 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.16 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  28.67 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  26.35 
 
 
274 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  28.82 
 
 
275 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  25.42 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.27 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2826  nitroreductase family protein  20.86 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0754464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  25.43 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3040  nitroreductase family protein  20.86 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.66988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  27.97 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  27.97 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>