More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2837 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  96.91 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  81.36 
 
 		 178 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  50.86 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  44.94 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  50.54 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  48.11 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  47.28 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  46.74 
 
 		 184 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  47.4 
 
 		 170 aa  165  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  44.62 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  44.89 
 
 		 176 aa  147  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  40.48 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  39.88 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.88 
 
 		 174 aa  121  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  41.61 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  37.43 
 
 		 180 aa  118  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  31.07 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  35.78 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  38.2 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  37.57 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.36 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  39.18 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  36.51 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  35.83 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  37.22 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  37.22 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  34.94 
 
 		 278 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  38.42 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  33.91 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.13 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  36.42 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  38.01 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  37.79 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  38.33 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  35.16 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.71 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  37.58 
 
 		 169 aa  97.8  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.08 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.53 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  37.66 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  37.66 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36.72 
 
 		 169 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.9 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.77 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  34.74 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  35.5 
 
 		 167 aa  95.9  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  36.36 
 
 		 169 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  31.76 
 
 		 175 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  29.71 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  35.36 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.98 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  30.1 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  32.56 
 
 		 214 aa  91.3  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  34.29 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  31.43 
 
 		 173 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.64 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.64 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.52 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.71 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.33 
 
 		 171 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  37.1 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  34.91 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.87 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.86 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  29.38 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  35.15 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.38 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  34.41 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  33.75 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  32.8 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.28 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  28.23 
 
 		 215 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.81 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  33.87 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30.95 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  26.47 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  32.26 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  34.24 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.67 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.59 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  32.26 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.18 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  32.26 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  31.18 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>