More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1011 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  100 
 
 
329 aa  669    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  59.47 
 
 
214 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  59.79 
 
 
215 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  39.88 
 
 
173 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.63 
 
 
174 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  33.14 
 
 
175 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.53 
 
 
194 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.99 
 
 
174 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  33.53 
 
 
194 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.53 
 
 
170 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  32.94 
 
 
178 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  34.48 
 
 
168 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  31.4 
 
 
175 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.13 
 
 
192 aa  93.6  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  31.4 
 
 
175 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  33.12 
 
 
175 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  36.13 
 
 
175 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.54 
 
 
176 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.71 
 
 
176 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.33 
 
 
163 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.05 
 
 
179 aa  85.1  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.51 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.73 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.29 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.28 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.15 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.77 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.77 
 
 
166 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.72 
 
 
176 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  33.54 
 
 
174 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.73 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.67 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  32.92 
 
 
174 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.09 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  34.78 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  32.3 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.57 
 
 
163 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.34 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.34 
 
 
171 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  29.55 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.77 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.09 
 
 
180 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  28 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  27.43 
 
 
169 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.14 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  28.05 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  30.43 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  27.93 
 
 
170 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.38 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  30.53 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.11 
 
 
188 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.98 
 
 
169 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  29.24 
 
 
176 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.76 
 
 
173 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  25.3 
 
 
171 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  29.07 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.52 
 
 
167 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.09 
 
 
197 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  34.39 
 
 
172 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  25.86 
 
 
171 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  28.81 
 
 
246 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.69 
 
 
206 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  23.2 
 
 
214 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  30.99 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.4 
 
 
175 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.61 
 
 
165 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  28.39 
 
 
176 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  23.4 
 
 
191 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.69 
 
 
204 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.19 
 
 
170 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.61 
 
 
184 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.07 
 
 
173 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  32.28 
 
 
174 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  25.38 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  24.87 
 
 
201 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.57 
 
 
190 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 
174 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  24.27 
 
 
221 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.97 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  30 
 
 
286 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.38 
 
 
187 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.38 
 
 
169 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  28.39 
 
 
170 aa  59.3  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  27.33 
 
 
273 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.92 
 
 
183 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  24.37 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  22.67 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.54 
 
 
584 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.14 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  27.53 
 
 
243 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  25.14 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  27.95 
 
 
257 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  30.59 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  25.28 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  27.33 
 
 
166 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.8 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  30 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.92 
 
 
202 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  26.24 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  25.81 
 
 
169 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>