More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2262 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  54.44 
 
 		 174 aa  194  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  50.31 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  50.3 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  50.31 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  49.1 
 
 		 176 aa  180  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  49.11 
 
 		 169 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  47.34 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  47.34 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  47.34 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  49.11 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  46.15 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  45.56 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  45.73 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  45.24 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  42.59 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  42.6 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  43.45 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  46.94 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  46.99 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  40.35 
 
 		 201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  38.1 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  39.05 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  38.1 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  40.85 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  43.53 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  40.24 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  38.89 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  40 
 
 		 274 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  36.36 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  36.7 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.9 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  40.94 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.57 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  37.85 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  41.06 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  37.95 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.64 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  39.16 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  38.96 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  37.33 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  36.99 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.06 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  35.37 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  37.65 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  35.29 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.94 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  35.85 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  37.58 
 
 		 194 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  32.43 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  33.55 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.33 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  34.09 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.01 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.03 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  36.24 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  33.99 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.53 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  36.71 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  33.55 
 
 		 173 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  32.17 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  32.52 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.43 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  34.01 
 
 		 278 aa  89  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.4 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  34.71 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  32.37 
 
 		 191 aa  87.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  35.46 
 
 		 171 aa  87.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.89 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.28 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.89 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.77 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.63 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  38.32 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.64 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  30.86 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  31.76 
 
 		 168 aa  84.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  34 
 
 		 163 aa  84  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.29 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  31.76 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.03 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.87 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  32.68 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.63 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  29.55 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.94 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.29 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.33 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.14 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.58 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  31.41 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  33.53 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  33.53 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30.99 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  30.99 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  40.52 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>