254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3049 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  100 
 
 		 170 aa  348  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  63.1 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  53.89 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  53.85 
 
 		 172 aa  194  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  55.09 
 
 		 182 aa  193  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  53.7 
 
 		 176 aa  190  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  51.5 
 
 		 195 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  53.29 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  52.47 
 
 		 173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  52.69 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  48.5 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  46.71 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  41.25 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40.26 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.93 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  36.54 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  34.81 
 
 		 169 aa  98.2  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  36.65 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  33.99 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  35.95 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.53 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.55 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.77 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  31.13 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.18 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.55 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.54 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  32.24 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.16 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.15 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.77 
 
 		 170 aa  84  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.85 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.94 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.14 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.48 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.99 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.33 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.85 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.95 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  32.08 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.25 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  36.42 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.95 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.97 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.87 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.21 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.4 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.41 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.81 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  35.57 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  32.45 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  26.75 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  26.75 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.39 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.25 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.41 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.43 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  30.57 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  25.62 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.1 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  26.75 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.38 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.63 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  33.13 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.71 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.3 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.81 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.09 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  32.26 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.97 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.19 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  30.26 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.93 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.12 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.18 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.97 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.82 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.25 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.14 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.07 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.16 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.72 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  29.22 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.92 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.18 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  24.52 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.43 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.43 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.79 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  27.11 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  24.28 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  29.28 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.95 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.57 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.13 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.27 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  25.68 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  25.9 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>