More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3226 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  100 
 
 		 187 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  44.63 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  41.52 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  40.48 
 
 		 169 aa  141  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  45.51 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  42.13 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  41.21 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  41.57 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  40.46 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  40.46 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  41.57 
 
 		 173 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  39.29 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  40.48 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  38.69 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  39.64 
 
 		 169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  42.86 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  43.93 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.93 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.24 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.65 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  36.9 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  38.29 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.5 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.9 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.75 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  33.92 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  40.12 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.16 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.29 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  32.16 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.84 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  36.54 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  36.84 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.95 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  31.79 
 
 		 274 aa  94.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  35.29 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.68 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.57 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  34.05 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.99 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  32.14 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.7 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  33.68 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.88 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.95 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.38 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.64 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  35.06 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.23 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  33.54 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  35.77 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.85 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.63 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  30.52 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.4 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  39.83 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  33.87 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.07 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.12 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.94 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.22 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.93 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.14 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  33.55 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.32 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  34.81 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.32 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.99 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.52 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.98 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  29.87 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  33.54 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.23 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.46 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  30.73 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.29 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.65 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  30.32 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.4 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.27 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.81 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.38 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  31.65 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.4 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  35.64 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  35.64 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32.76 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.65 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.76 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.8 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.66 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.66 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.07 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  30.4 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25.77 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  34.42 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  29.81 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>