More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1624 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  100 
 
 		 176 aa  361  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  54.34 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  50.58 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  53.89 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  52.33 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  53.49 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  50.87 
 
 		 176 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  50.58 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  48.28 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  53.85 
 
 		 175 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  52.6 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  48.55 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.31 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.72 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  36.09 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  35.33 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  34.57 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  35.95 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  39.74 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.42 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.82 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.42 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.05 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.54 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.33 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  34.64 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.39 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30.68 
 
 		 168 aa  91.3  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  32.48 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  32.48 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.52 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.48 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.99 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.71 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.16 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.06 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.11 
 
 		 278 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.98 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.57 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.33 
 
 		 168 aa  84  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.07 
 
 		 169 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.35 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.54 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.21 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.73 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.48 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  34.71 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.13 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  29.48 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  31.79 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.41 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  28.57 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.86 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.52 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.48 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.11 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.48 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.28 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  25.64 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.11 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  33.33 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.87 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  25.43 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.87 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.37 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.14 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  30.12 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.76 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  29.07 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.76 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.95 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  29.07 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.17 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.65 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.57 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.24 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.93 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  26.14 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.21 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.88 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  29.2 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.83 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  29.5 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.27 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.07 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  26.55 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  30.83 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.25 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.25 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  25.17 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  28.48 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.5 
 
 		 273 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.55 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.06 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.64 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.82 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  29.52 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  26.35 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>