More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0837 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  100 
 
 
173 aa  359  9e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  97.11 
 
 
173 aa  348  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  94.22 
 
 
173 aa  342  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  82.66 
 
 
173 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  50.6 
 
 
166 aa  190  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  50 
 
 
166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  50.3 
 
 
176 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  46.43 
 
 
174 aa  167  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  39.88 
 
 
169 aa  157  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  36.47 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  43.98 
 
 
169 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  39.88 
 
 
169 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  40.94 
 
 
171 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  40.94 
 
 
171 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  41.07 
 
 
169 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  44.58 
 
 
174 aa  148  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  42.01 
 
 
169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40.49 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  39.05 
 
 
169 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  45.56 
 
 
170 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  39.16 
 
 
169 aa  142  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  35.71 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  39.76 
 
 
169 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  41.57 
 
 
187 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  35.12 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  39.29 
 
 
169 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.5 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.91 
 
 
167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  44.44 
 
 
169 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.33 
 
 
197 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  40.35 
 
 
274 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  38.69 
 
 
166 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  36.09 
 
 
169 aa  108  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  37.43 
 
 
170 aa  104  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  32.75 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.53 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.86 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  34.67 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.75 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.55 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  32.95 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.29 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  32.3 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.57 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.69 
 
 
186 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.25 
 
 
191 aa  89  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.98 
 
 
172 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  39.1 
 
 
172 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.46 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  28.98 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30.46 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  32.62 
 
 
184 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.14 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  30.54 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.97 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.55 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.22 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.32 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.59 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.27 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.37 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.94 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.38 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  31.58 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.81 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  30.65 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  35.48 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.57 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.07 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.21 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.86 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.8 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  25.43 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  29.49 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.28 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.14 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.74 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.86 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.34 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.74 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.5 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.14 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.58 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.64 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.1 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  30.57 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.57 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.39 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  30.43 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.52 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.57 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.37 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.9 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.54 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  30.86 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.58 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.99 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.27 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  25.44 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>