286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3002 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  63.95 
 
 
176 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  61.36 
 
 
182 aa  236  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  63.37 
 
 
172 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  61.63 
 
 
172 aa  225  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  53.49 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  50.58 
 
 
176 aa  195  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  51.5 
 
 
170 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  51.16 
 
 
176 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  54.49 
 
 
170 aa  185  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  52.33 
 
 
175 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  41.28 
 
 
173 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  42.35 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  35.47 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.56 
 
 
172 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  38.06 
 
 
163 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.2 
 
 
176 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30.68 
 
 
169 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.76 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.41 
 
 
169 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.82 
 
 
170 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.28 
 
 
171 aa  87.8  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.93 
 
 
178 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.61 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.54 
 
 
170 aa  87  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.81 
 
 
169 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  29.65 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.24 
 
 
278 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.98 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.8 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.18 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  33.73 
 
 
169 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.93 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.01 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.98 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  26.59 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  31.54 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  25.43 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.86 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.87 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.31 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.87 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.82 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  27.43 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  28.81 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25.86 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.41 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.31 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.64 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.07 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.22 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.34 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  27.92 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  28.65 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.3 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  26.49 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.17 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.19 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.24 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.91 
 
 
214 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.34 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.91 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.4 
 
 
184 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.75 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.38 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.48 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.67 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.99 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  28.48 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.16 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.17 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.01 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.59 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.81 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.09 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.45 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.06 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.11 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.39 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  26.34 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.17 
 
 
163 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.78 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.45 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  27.56 
 
 
363 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.61 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.8 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  25.97 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.04 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  26.63 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.97 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.93 
 
 
181 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  26.32 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  26.58 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.19 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  25.31 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  26.11 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>