More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1074 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  100 
 
 		 167 aa  343  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  73.05 
 
 		 167 aa  257  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  58.54 
 
 		 173 aa  192  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  56.17 
 
 		 170 aa  190  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  56.89 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  50.31 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  48.48 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  52.12 
 
 		 174 aa  161  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  54.22 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  54.88 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  39.38 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.93 
 
 		 165 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  38.82 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  38.82 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  34.1 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  37.33 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  34.41 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36.47 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.28 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.74 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  36.14 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  36.48 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.95 
 
 		 196 aa  101  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.15 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.14 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  35.33 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.82 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  37.82 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  32.26 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  35.33 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  35.44 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.33 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  35.5 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.75 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  34.67 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  34.67 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.36 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.81 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  35.44 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  34.81 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  34.81 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.32 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.73 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  36.02 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.53 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.54 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.93 
 
 		 174 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.76 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  33.11 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  34.48 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  33.53 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  39.35 
 
 		 274 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  35.29 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.08 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  34.5 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  39.87 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.43 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.69 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  35.06 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.92 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.16 
 
 		 197 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.61 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  34.73 
 
 		 257 aa  85.1  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  32.83 
 
 		 209 aa  84.3  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  34.64 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.17 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.12 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.36 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.33 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  38.51 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.1 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.77 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  32.14 
 
 		 350 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  30.68 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.24 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  32.61 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.83 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.98 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.93 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.77 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.77 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.8 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  29.35 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  28.64 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  29.14 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  31.87 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.92 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  34.18 
 
 		 240 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  32.75 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  34.69 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.47 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.93 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.87 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  31.1 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  30.99 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  34.09 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>