More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3266 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  48.52 
 
 
170 aa  167  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  47.62 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  44.12 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  39.88 
 
 
194 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  40.48 
 
 
178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  39.88 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  39.88 
 
 
178 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.28 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.14 
 
 
186 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.91 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  34.17 
 
 
204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  36.11 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  39.18 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  37.27 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.05 
 
 
186 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  32.93 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  32.12 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.07 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  38.12 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  38.56 
 
 
278 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  36.46 
 
 
181 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  36.46 
 
 
181 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  35.98 
 
 
190 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.93 
 
 
179 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  38.06 
 
 
192 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  32.16 
 
 
181 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.75 
 
 
166 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  34.16 
 
 
174 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  32.16 
 
 
184 aa  97.8  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  36.02 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  34.42 
 
 
171 aa  97.1  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.55 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.49 
 
 
181 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.79 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.7 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  36.42 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.52 
 
 
190 aa  94  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  36.42 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.33 
 
 
187 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  32.94 
 
 
173 aa  90.9  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  33.33 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.33 
 
 
188 aa  88.2  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.19 
 
 
176 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.94 
 
 
180 aa  87.8  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  30.41 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  29.94 
 
 
170 aa  87.4  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  33.33 
 
 
175 aa  87  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  32.75 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  31.33 
 
 
329 aa  86.3  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.73 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.05 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.93 
 
 
215 aa  84.7  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  34 
 
 
169 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.62 
 
 
171 aa  84  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.53 
 
 
206 aa  84  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.71 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.94 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  27.27 
 
 
199 aa  82  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  28.5 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  29.73 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  34.88 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.69 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  34.72 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  30.46 
 
 
321 aa  81.3  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.83 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  35.29 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.36 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  28.92 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.89 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.77 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.72 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.17 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.09 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.16 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.52 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.97 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  29.78 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  35.29 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.12 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  28.65 
 
 
238 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.65 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  32.52 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.74 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.68 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.48 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  30.05 
 
 
316 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  32.03 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.43 
 
 
208 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  34.88 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  29.41 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.83 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.59 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  32.73 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.33 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.7 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>