More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1679 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  100 
 
 
199 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  65.83 
 
 
199 aa  293  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  34.85 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  36.76 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  35.03 
 
 
214 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  33 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  34.04 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.83 
 
 
218 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  29.29 
 
 
206 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  26.9 
 
 
208 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.3 
 
 
215 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  31.41 
 
 
208 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  33.99 
 
 
211 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  31.4 
 
 
220 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  32.16 
 
 
211 aa  104  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  34.3 
 
 
217 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0247  nitroreductase  27.78 
 
 
206 aa  102  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  35.03 
 
 
210 aa  101  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  33.33 
 
 
211 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  32.85 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  33.17 
 
 
233 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  29.81 
 
 
224 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  31.38 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  26.53 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  30.14 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.93 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  33.52 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  32.55 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  30.58 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  32.68 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.29 
 
 
201 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  32.68 
 
 
217 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  34.85 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  32.78 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  30.32 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.08 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  29.02 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  32.2 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.31 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.5 
 
 
204 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1083  nitroreducatase family protein, authentic frameshift  27.96 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  31.25 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  32.04 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.54 
 
 
220 aa  92  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  29 
 
 
205 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  33.33 
 
 
211 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  30.92 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  30.48 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  29.79 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  29 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  29.5 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  29 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  29 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  30.77 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  31.47 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  29 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  28.16 
 
 
237 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  26.02 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0920  nitroreductase  27.14 
 
 
202 aa  89  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  27.43 
 
 
270 aa  89  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  25.51 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  28.8 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  30.65 
 
 
214 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  30 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  25 
 
 
201 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  31.8 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  33.5 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  27.67 
 
 
218 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  26.92 
 
 
218 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  27.62 
 
 
215 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  31.36 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  27.88 
 
 
218 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.2 
 
 
220 aa  85.9  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  31.19 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  28.29 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  30.72 
 
 
223 aa  85.1  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  30.72 
 
 
223 aa  85.1  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  30.29 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  26.55 
 
 
270 aa  84.7  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  31.37 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  29.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  29.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  29.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  29.79 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  29 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  28.37 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  31.22 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  31.92 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.91 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  29.26 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  29.95 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  30.57 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>