200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0876 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  100 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  96.77 
 
 
217 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  95.85 
 
 
217 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  94.01 
 
 
217 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  93.09 
 
 
217 aa  427  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  88.94 
 
 
217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  88.94 
 
 
217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  88.94 
 
 
217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  88.94 
 
 
217 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  77.88 
 
 
217 aa  350  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  76.04 
 
 
217 aa  333  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  76.04 
 
 
217 aa  327  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  59.72 
 
 
217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  55.92 
 
 
217 aa  265  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  63.16 
 
 
217 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  57.01 
 
 
217 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  56.54 
 
 
217 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 
217 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 
217 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 
217 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  250  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  56.94 
 
 
217 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  54.88 
 
 
217 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  53.24 
 
 
216 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 
217 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 
217 aa  248  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  55.09 
 
 
217 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  55.09 
 
 
217 aa  248  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  247  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  54.63 
 
 
217 aa  247  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  55.09 
 
 
217 aa  246  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  51.64 
 
 
220 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  55.05 
 
 
216 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  50 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  35.64 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.82 
 
 
218 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  33.49 
 
 
218 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  33.5 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  33.99 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  32.86 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  33.01 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  30.62 
 
 
218 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  31.58 
 
 
237 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  31.13 
 
 
216 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31.07 
 
 
215 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  30.8 
 
 
220 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  32.23 
 
 
208 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.14 
 
 
218 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  30.18 
 
 
212 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  32 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  30 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  31.1 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  27.88 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.16 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  31.73 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  31.78 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.37 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.37 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.37 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  28.3 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.75 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.09 
 
 
224 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.17 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  31.43 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.37 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.44 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.17 
 
 
227 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  31.46 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.7 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.63 
 
 
227 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  29.38 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  26.89 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  29.63 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  32.68 
 
 
199 aa  86.3  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  32.21 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  30.56 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  30.7 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.11 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  29.17 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  28.99 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  27.48 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  30.89 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.9 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  30.63 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.38 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  28.16 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  28.16 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  26.17 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  28.95 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  27.05 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  28.37 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  29.02 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.87 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>