181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2510 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  100 
 
 
218 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  77.52 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  77.52 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  75.23 
 
 
218 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  75.23 
 
 
218 aa  349  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  67.43 
 
 
218 aa  320  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  62.84 
 
 
237 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  61.47 
 
 
218 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  59.17 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  38.89 
 
 
217 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  38.14 
 
 
217 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  37.44 
 
 
217 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  35.38 
 
 
218 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  36.97 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  35.44 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  34.29 
 
 
217 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  35.75 
 
 
217 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  34.29 
 
 
217 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  35.75 
 
 
217 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  34.29 
 
 
217 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  33.33 
 
 
218 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.52 
 
 
217 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  35.75 
 
 
217 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  35.75 
 
 
217 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  34.29 
 
 
217 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  35.75 
 
 
217 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  35.27 
 
 
217 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  35.27 
 
 
217 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  35.27 
 
 
217 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  35.27 
 
 
217 aa  121  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  35.65 
 
 
220 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  33.5 
 
 
217 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  33.5 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  31.46 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  33.66 
 
 
217 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  34.62 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  35.12 
 
 
217 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.84 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  33.99 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  33.5 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  37.56 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  32.23 
 
 
217 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  34.6 
 
 
200 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  28.97 
 
 
215 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  33.17 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.49 
 
 
209 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.73 
 
 
211 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  30.95 
 
 
201 aa  99  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  32.37 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  29.86 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  30.56 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  30.39 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  32.21 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  28.85 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  28.02 
 
 
214 aa  92  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  29.25 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  32.31 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  29.03 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  30.73 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  27.83 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  30.21 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  34.17 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  29.96 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  29.96 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  26.64 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  28.95 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  29.3 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  28 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.44 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  29.58 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  28.57 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.75 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  28.64 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  27.03 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.32 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.67 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  26.36 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.2 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.32 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.23 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.32 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.96 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  28.76 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  27.88 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  27.45 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  26.9 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  30.3 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.03 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  28.04 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  26.54 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  25.69 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  24.34 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  29.5 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  26.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  28.93 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  26.19 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  22.75 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>