248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4019 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  75.96 
 
 
233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  74.16 
 
 
210 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  71.63 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  70.14 
 
 
211 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  67.31 
 
 
210 aa  292  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  54.5 
 
 
210 aa  245  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  51.43 
 
 
232 aa  235  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  58.17 
 
 
209 aa  228  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  47.85 
 
 
211 aa  198  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  47.87 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  43.48 
 
 
210 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  41.35 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  39.02 
 
 
214 aa  168  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  40.78 
 
 
215 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  39.13 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  40.38 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  38.35 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  38.73 
 
 
210 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  36.71 
 
 
218 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  35.96 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  35.71 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  35.07 
 
 
219 aa  124  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  34.26 
 
 
217 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  33.8 
 
 
217 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  33.33 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  34.42 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  29.13 
 
 
224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  35.92 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  33.81 
 
 
208 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  30.36 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  33.65 
 
 
199 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  33.33 
 
 
199 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.63 
 
 
208 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  31.43 
 
 
215 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.7 
 
 
216 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  30.85 
 
 
209 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  29.6 
 
 
217 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  29.91 
 
 
217 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  29.46 
 
 
217 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  29.46 
 
 
217 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  31.94 
 
 
217 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  29.53 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  26.32 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  31.58 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  27.27 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  27.14 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  30.3 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  29.09 
 
 
222 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  27.72 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  30.14 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.09 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  26.42 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  26.89 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.37 
 
 
227 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.37 
 
 
227 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  31.36 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.19 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.83 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.88 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  28.31 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  25.23 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  29.57 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.37 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  26.34 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  29.07 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  25.37 
 
 
227 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  29.13 
 
 
218 aa  89  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  28.1 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  24.77 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  26.46 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  31.4 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  26.94 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  31.1 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  24.3 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  24.3 
 
 
217 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  24.3 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  24.3 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  25.11 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  24.66 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  25 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  28.79 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  24.66 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  24.66 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  28.7 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  28.64 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  27.68 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  24.49 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  27.27 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  24.49 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  26.36 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  30.99 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  25.76 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  29.14 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>