215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0631 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  98.62 
 
 
217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  97.7 
 
 
217 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  98.16 
 
 
217 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  88.94 
 
 
217 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  88.02 
 
 
217 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  88.48 
 
 
217 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  88.02 
 
 
217 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  88.02 
 
 
217 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 
217 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 
217 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  87.56 
 
 
217 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  88.02 
 
 
217 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  85.25 
 
 
217 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  61.75 
 
 
217 aa  291  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  58.53 
 
 
217 aa  277  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  56.48 
 
 
217 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  56.48 
 
 
217 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  54.88 
 
 
217 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  54.17 
 
 
217 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  54.17 
 
 
217 aa  255  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 
217 aa  255  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  54.17 
 
 
217 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  54.17 
 
 
217 aa  255  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 
217 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  54.42 
 
 
217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 
217 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  53.95 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  58.37 
 
 
217 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  54.33 
 
 
218 aa  244  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  57.89 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  53.59 
 
 
218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  53.95 
 
 
217 aa  234  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  55.98 
 
 
217 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  46.08 
 
 
216 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  48.84 
 
 
220 aa  217  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  51.15 
 
 
217 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  48.85 
 
 
216 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  36.45 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  36.15 
 
 
218 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  36.71 
 
 
218 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  33.81 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  34.29 
 
 
218 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.87 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  31.94 
 
 
218 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  36.24 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  31.58 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.84 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  32.35 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  30.52 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  31.19 
 
 
218 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  31.07 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  29.82 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  29.46 
 
 
211 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  30.37 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  27.57 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  28.7 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  30 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  31.11 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  26.98 
 
 
233 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  30.23 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  30.5 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  28.14 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.84 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.62 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  27.4 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  25.59 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  25.76 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.31 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  28.78 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  28.84 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  28.84 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  28.31 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  29.47 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  29.63 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  29.68 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.12 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  28.36 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.92 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.67 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  27.92 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  27.85 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  25.25 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  28.5 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  31.11 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  29.25 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  27.83 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  30.05 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  27.91 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  25.35 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  28.5 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  26.19 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  26.91 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  28.32 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  25.33 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  26.9 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  26.85 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  25.38 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  26.19 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>