199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0911 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  98.62 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  93.09 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  92.63 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  92.17 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  88.48 
 
 		 217 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  78.34 
 
 		 217 aa  348  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  75.58 
 
 		 217 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  75.12 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  60.19 
 
 		 217 aa  280  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  63.16 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  54.98 
 
 		 217 aa  261  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  56.48 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  56.07 
 
 		 217 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  55.61 
 
 		 217 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  54.67 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 		 217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  55.56 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  55.56 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  55.35 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  55.09 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  56.02 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  54.67 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  55.56 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  52.78 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  56.48 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  50.93 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  49.77 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  53.21 
 
 		 216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  35.64 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  33.49 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  33.82 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  33 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  33.81 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  33.5 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  33.5 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  30.96 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.06 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  31.1 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  33.96 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  31.58 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  30.19 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  31.8 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  30 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  32.21 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  29.47 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.02 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  30.81 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.29 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  26.79 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  29.94 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  31.6 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  30.37 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  33.17 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  28.18 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  32.86 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  32.71 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  29.44 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  28.38 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  29.17 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  30 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  28.24 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  29.81 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  30.05 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  34.65 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.64 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.97 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  24.77 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  28.7 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  30.77 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  28.83 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  26.58 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  29.41 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  29.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  29.02 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  27.49 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  30.05 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  28.11 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  29.28 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.38 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  29.84 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  27.08 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  26.73 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  25.6 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1477  nitroreductase family protein  29.9 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0351255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>